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2017
03-23
人参考基因组不同版本区别 CRCH37 vs b37 vs hg19 vs hsd537 vs GRCH38 余欢 如果使用基于GRCH37的衍生参考基因组版本,建议使用hs37d5,这几个版本的基因组的主要区别介绍如下: 1)GRCH37,b37,hs37d5(b37+decoy)与hg19、GRCH38(hg38)的来源: hg19来自UCSC,GRCH37来自NCBI,b37来自千人基.... Read More >
2017
03-15
R与Python中的Fisher exact test实现与异同 余欢      背景      我们在做病例对照研究中,经常会用到Fisher检验,目前文章中常用的都是R中的Fisher检验。一次偶然的经历,使用了python做Fisher检验,发现两种方法得到的结果并不一致,于是好奇研究一下到底是什么原因。      经过查询发现,这是由于两种语言中使用的F.... Read More >
2016
03-14
HaploPainter,是一款简单易上手的家系图绘制软件,能通过直接新建,或者导入Ped,CSV格式的文件快速绘制家系图,链接:(https://sourceforge.net/projects/haplopainter/)。 比如通过直接新建家系,只需要打开软件,选择Edit->New .... Read More >